Referencelaboratorium for tarmbakteriologi

Det nationale referencelaboratorium (NRL) for fødevarebårne og tarmpatogene bakterier er ansvarlig for typebestemmelse, resistenstestning, overvågning og forskning i relation til en lang række bakterielle patogener. SSI’s overvågnings- og beredskabsopgaver er reguleret i sundhedslovens § 222.

NRL for fødevarebårne og tarmpatogene bakterier i folkesundheden er en del af sektionen for fødevarebårne infektioner (NRL-FBI) i afdelingen for Bakterier, Parasitter og Svampe (BPS).

NRL-FBI støtter de regionale afdelinger for klinisk mikrobiologi (KMA) ved at levere referencediagnostik, referencematerialer og videnskabelig rådgivning inden for fødevarebårne og tarmpatogene bakterielle infektioner. NRL udfører den laboratoriebaserede overvågning af disse infektioner, herunder typning, virulenskarakterisering og antimikrobiel resistens testning af isolater modtaget fra KMA’er. De anvendte metoder inkluderer helgenom-sekventering (WGS) samt molekylære eller fænotypiske metoder til en bred vifte af bakterier. Data bruges til at opdage udbrud, identificere kilder og smitteveje, følge trends osv. Dette arbejde sker i tæt samarbejde med andre interessenter på nationalt og internationalt niveau.

Overvågningsdata rapporteres til nationale og internationale myndigheder (ECDC’s TESSy og EpiPulse), og data offentliggøres blandt andet i Annual Report on Zoonoses in Denmark, DANMAP og på SSI’s hjemmeside om overvågningsdata.

NRL-FBI har et stærkt samarbejde med netværket af KMA'er i Danmark, netværk og projekter på EU-niveau samt globale netværk med det formål at forbedre og udvikle overvågningen og responsen i forhold til fødevarebårne og tarmpatogene infektioner.

Den teknologiske og videnskabelige udvikling sikres af forskningsaktiviteter, der dækker en bred vifte af emner relateret til de specifikke patogener eller laboratorieteknologier. Se mere på de patogenspecifikke sider nedenfor.

Bakterier under særlig overvågning:

  • Campylobacter spp.
  • Clostridioides difficile
  • Diarrhoea-inducing E. coli
  • Listeria monocytogenes
  • Salmonella spp.
  • Shigella
  • Vibrio spp.
  • Yersinia enterocolitica

Data for overvågningen rapporteres i Annual report on Zoonoses in Denmark

DANMAP, rapport udgives årligt med resistensdata for bl.a. Salmonella og Campylobacter
Det aktuelle antal infektioner i Danmark kan løbende findes på Overvågning i tal, grafer og kort.

EU-finansierede aktiviteter for Food- and Waterborne Disease Network (FWD-Net)
Sektionen for fødevarebårne infektioner yder støtte til netværket af nationale referencelaboratorier i EU i FWD-Net gennem aktiviteter som:

  • External Quality Assessments (EQA) for typning og antimikrobiel resistenstestning organiseres og rapporteres (yderligere information under de relevante patogener anført ovenfor). Disse tilrettelægges i samarbejde med European Center for Disease Prevention and Control (ECDC) 

  • FWD AMR-RefLabCap-projektet (afsluttet i 2024) yder støtte og kapacitetsopbygning til NRL'erne til test og overvågning af antimikrobiel resistens i Salmonella og Campylobacter i humane prøver. Dette omfatter vejledningsdokumenter, EQA'er, træning, netværk osv. Læs mere på projektets hjemmeside.

  • EURL-PH-FWDB SSI er leder af et nyt EU Referencelaboratorium i public health vedrørende de fødevare- og vandbårne bakterier. EURL’ens aktiviteter forventes at begynde i januar 2026.