Forskning i HIV-1 molekylærepidemiologi og resistens

Fokusområder og formål

Til forskningsindsatsen anvendes der en kombination af laboratoriegenererede sekvensdata fra HIV-1 pol genet og epidemiologiske oplysninger for at kortlægge, hvilke subtyper der cirkulerer i Danmark samt hvilke der importeres fra udlandet. Derudover undersøges forekomsten af mutationer, der kan give behandlingsresistens blandt forskellige subtyper og epidemiologiske risikogrupper.

Links til udvalgte publikationer

• Identification of risk factors associated with national transmission and late presentation of HIV-1, Denmark, 2009 to 2017. Maarten van Wijhe,Thea K Fischer, Jannik Fonager. Euro Surveill. 2021 Nov;26(47):2002008. PMID: 34823639 DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.47.2002008
• Piloting a surveillance system for HIV drug resistance in the European Union. Marita Jw van de Laar et. al. Euro Surveill. 2019 May;24(19):1800390. PMID: 31088600 DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2019.24.19.1800390
• Characterisation of HIV-1 transmission clusters  and drug-resistant mutations in Denmark, 2004 to 2016. Petersen A, Cowan SA, Nielsen J, Fischer TK, Fonager J. Euro Surveill 2018 Nov;23(44). PMID: 30401010 DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2018.23.44.1700633
• HIV-1 transmission between MSM and heterosexuals, and increasing proportions of circulating recombinant forms in the Nordic Countries. Esbjornsson J, Mild M, Audelin A, Fonager J, Skar H, Bruun JL, et al. Virus Evol 2016 Jan;2(1):vew010. PMID: 27774303 PMCID: PMC4989887 DOI: 10.1093/ve/vew010
• Phylogenetics of the Danish HIV epidemic: the role of very late presenters in sustaining the epidemic. Audelin AM, Cowan SA, Obel N, Nielsen C, Jorgensen LB, Gerstoft J. J Acquir Immune Defic Syndr 2013 Jan 1;62(1):102-8. PMID: 23075917 DOI: 10.1097/QAI.0b013e318276becc
• Molecular phylogenetics of transmitted drug resistance in newly diagnosed HIV Type 1 individuals in Denmark: a nation-wide study. Audelin AM, Gerstoft J, Obel N, Mathiesen L, Laursen A, Pedersen C, et al. AIDS Res Hum Retroviruses 2011 Dec;27(12):1283-90. PMID: 21564007 DOI: 10.1089/aid.2010.0368

Forskningsprojekter

SERO projektet

SERO projektet blev påbegyndt i år 2000, og inkluderer ~ 50% af alle med ny påvist HIV-1 i Danmark i perioden. Her modtages en blodprøve og epidemiologiske informationer fra patienter første gang de har fået eller får påvist en HIV-infektion.

HIV-1 i prøven bliver undersøgt ved hjælp af genotypisk resistensbestemmelse, der foregår via opformering (RT-PCR) og aflæsning (sekvensering) af den genetiske information i HIV-1 pol genet. HIV-1 sekvenserne undersøges med fylogenetiske metoder for at se, om der sker en ændring i hvilke HIV-1 subtyper der findes og cirkulerer i Danmark. Derudover undersøges forekomsten af transmitteret resistens i forhold til smitteclustre og risikogrupper.

Udover de studier der linkes til ovenfor, præsenteres det seneste års data fra SERO projektet i den årlige opgørelse i SSI's i EPI-NYT, der udgives sammen med Afdeling for Infektionsepidemiologi og Forebyggelse.

Derudover rapporteres forekomsten af resistens (pre-treatment drug resistance) årligt til det Europæiske sundhedsagentur (ECDC).

Den danske HIV sekvens database

Den danske HIV sekvens database (DHS) er oprettet med det formål at indsamle og administrere danske HIV-1 gensekvenser. Gensekvenserne anvendes til overvågning og karakterisering af HIV-1 resistens og HIV-1 variabilitet hos behandlede og ubehandlede patienter i Danmark. 

DHS er godkendt af Datatilsynet. 

Samarbejdspartnere 

Ud over alle de infektionsmedicinske afdelinger i Danmark er der også etableret et samarbejde med European Society for translational Antiviral Research (ESAR), som er et europæisk samarbejde igangsat af EU.

Formålet med projektet er at undersøge prævalensen af subtyper og transmitteret resistens blandt nydiagnosticerede HIV-1 patienter i Europa. Ansvarlig: Medical Centre Utrecht, the Netherlands.