Blastocystis sp. subtype (DNA) (R-nr. 1048)
Indikation
Ved fund af Blastocystis og ønske om information om subtype.
Prøvemateriale, tidspunkt og evt. prøvetagning
Til analysen skal der indsendes:
- Fæces
Rekvirering
Undersøgelsen kan rekvireres i WebReq under laboratoriet Statens Serum Institut eller på blanket nr. 11 "Svampe og parasitter" (mørk orange kant).
Svar
Svares som Blastocystis sp. subtype 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 eller 9 påvist, ikke påvist eller inkonklusiv.
Inkonklusiv svares hvis prøven indeholder inhiberende stoffer i forhold til PCR analysen.
Svartid
Svar afgives ca. 1 uge efter prøvens modtagelse.
Tolkning og reference-værdier/interval
Subtyperne 1, 2, 3 og 4 er almindeligt forekommende hos danskere, mens smitte med subtype 5, 6, 7, 8 og 9 sandsynligvis sker overvejende fra dyr til mennesker. I Danmark ses disse subtyper i mindre end 10% af Blastocystis-bærere.
På genom-niveau er de forskellige subtyper forskellige og det kan ikke udelukkes, at der ses udsving i klinisk præsentation mellem de enkelte subtyper.
Relaterede analyser
- Tarmprotozoer (DNA) (Cryptosporidium arter, Entamoeba dispar, Entamoeba histolytica og Giardia duodenalis) (R-nr. 070)
- Parasit (Cyste+Ormeæg+Orme) (R-nr. 071)
- Entamoeba histolytica og Entamoeba dispar (DNA) med artsdifferentiering (R-nr. 075)
- Cryptosporidium arter og Giardia duodenalis (DNA) (R-nr. 077)
- Blastocystis (DNA) (R-nr. 1045)
- Blastocystis (dyrkning) (R-nr. 097)
Sensitivitet og specificitet
Subtypning af Blastocystis fra dyrkning er kun yderst sjældent problematisk. Derimod kan subtypning af Blastocystis direkte fra fæces af og til volde vanskeligheder pga. moderat primer-specificitet.
Subtypning tillader følsom diskrimination mellem forskellige subtype-alleler og har næsten samme resolution som multilocus-sekvens-typning.
Overvågning af patient-stammer kan med fordel ske vha. såvel PCR som dyrkning af fæces med efterfølgende subtypning og allel-identifikation.
Analysens princip
Karakteristik af small subunit rRNA genet. Kun subtypen svares ud, men man kan ved henvendelse til laboratoriet få oplysning om subtype-allel.
IVDR risikoklasse: B
In house komponent: Mastermix (primere og prober)
Internt reference nummer: R-nr. 1048
Komponenten opfylder generelle krav til sikkerhed og ydeevne.
Synonym
Blastocystis, blastocystose, blastocystosis
Bestillingskode
NPU29344 F—Blastocystis sp. subtype(DNA); arb.indh.(proc.) = ?
430343043300000 Blastocystis (subtype) DNA/RNA - Fæces
Svarkode
NPU29344 F—Blastocystis sp. subtype(DNA); arb.indh.(proc.) = ?
Pris
Artikel nr. | Pris 2024 |
---|---|
91397 | 1.765,00 |
Sygdomsbeskrivelser
Henvendelse
Bakterier, Parasitter & Svampe
Mykologisk & Parasitologisk Specialdiagnostik
T. 3268 8600
F. 3268 3033
@. afdMI@ssi.dk
Telefontid:
Mandag-torsdag kl. 8.00-15.30
Fredag kl. 8.00-15.00